Тёмный кристалл: Эпоха сопротивления

В землях Тра молодой страж узнаёт ужасную тайну о повелителях Скексисах, которые контролируют планету, и могущественный Кристалл Истины.

Из долгого сна пробуждается мать Огра. Дит на поверхности встречает Хапа, который клянётся защищать её. Тем временем принцесса клана Вапра Брея в своих видениях увидела таинственный символ и всеми возможными способами стремится истолковать его, или найти у других ответ на свой вопрос. Она ищет ответа у старейшины Кадии из клана Сифа, однако ненароком стирает ему память. Тем не менее Оника, помощница старейшины тайно предлагает Брее ответ на её вопрос в обмен на ярчайший камень покоев Аль-Мадры. Тем не менее стирание памяти становится причиной дипломатического скандала. Разозлённая мать ссылает дочь на исправительный работы. Скексисы тем временем поручают отцу Риана найти сына-«предателя».

Дит и Хап путешествуют в лесу и в результате перепалки с местными, Хапа задерживают. Риан безуспешно пытается донести правду о злодеяниях скексисов до Мадры Фары, но спасается бегством. Так, Риан встречается с Дит. Тем временем мать Огра прибывает к скексисам, не подозревая, что те уже давно пожирают силу кристалла и была ими же изгнана. Брея сослана в орден малой службы в качестве наказания, но сбегает оттуда. Вскоре она встречается с Таврой, которая была послана найти и схватить Риана. Брея тайно проникает в покои своей матери и крадёт «ярчайший камень» — куколку бабочки Юнамот. Оника наказывает Брее следовать за вылупившейся бабочкой, которая приводит юную принцессу обратно в Ха'рар, к тайному ходу под троном матери.

Дит освобождает Хапа из темницы клана Каменного леса, притворяясь монстром, испугавшем охранников. В Ха'раре Бреа пытается разгадать загадку тайной камеры, прежде чем понять, что иерархия клана Гельфлингов ложна. Брея пробуждает каменного гиганта, готовый провести Брею туда, где «располагается ключ к победе над скексисами». Риан отдыхает в пивной, однако нарывается на Найю, Кайло, принцессу Тавру и своего отца, которые намереваются поймать героя, Однако Риан уговаривает их «сновидеться» с ним, чтобы те вычитали его воспоминания и узнали правду о скексисах.

Риана выслеживают сами скексисы и захватывают его в плен, однако герою удаётся сбежать. Принцесса Брея пытается убедить Аль-Мадру и Селадон в том, что злодеяния скексисов — это правда, но безрезультатно. Тем временем Дит пытается добиться аудиенции с Аль-Мадрой, чтобы рассказать ей о распространении потемнения по всей Тра. В это время мать Огра вступает в духовный астрал и связывается со всеми героями через «сновидение», чтобы всех предупредить о том, что миру Тра грозит смерть, и только герои могут спасти его от скексисов. Селадон отказывается в это верить, поспорив с «прозревшей» матерью, сдаёт её скексисам, которые убивают Аль-Мадру.

Правда о злодеяниях скексисов, подобно пожару распространяется среди гельфлингов. Главные герои поминают смерть Аль-манды и отправляются в пустыню, следую за каменным гигантом в поисках круга Солнц, где располагается ответ на вопрос, как свергнуть власть скексисов. Тем временем Селадон пытается убедить остальных старейшин кланов посягнуть ей на верность в борьбе с мятежниками, однако не встречает однозначной поддержки. Скексисы предлагают аратимам — улью насекомых службу в обмен на возвращение им подземелья, отобранного когда то скексисами. Однако скексисы умолчали о том, что подземелье поражено «потемнением».

Герои прибывают в круг Солнц, где встречают доброго скексиса-еретика по имени скекГра, живущим вместе с мистиком по имени урГо. Они раскрывают истину о происхождении своих рас, о том, что скексисы и мистики были когда то единой инопланетной расой — урсКеками, которым мать Огра доверила хранение кристалла истины. Однако в результате экспериментов, каждый урсКек разделился на две сущности — хаотичную сущность скексиса и мирную сущность — мистиков. СкекГра единственный пытался убедить скексисов стать снова единым целым с мистиками, но был за это изгнан. Мадра Фара вместе с кланом Гроттам начала готовить восстание против скексисов, но была атакована полчищем насекомых. На главных героев напал скекМал, похитивший принцессу Тавру.

Риан и Дит отправляются в подземелье, в поисках меча, способного победить скексисов. Однако сталкиваются там с аратимами, захватившими всех гроттанов. Тем не менее из-за «потемнения», местные животные убивают и аратимов. Главные герои доносят до насекомых, что скексисы обманули и их, поэтому аратимы решают объединится с мятежниками против скексисов. Тем временем скексисы решают, что Селадон не приносит им пользы и решают её заточить вместе с другими гельфлингами. Только тогда Селадон осознаёт свою ошибку. Древо истины, погибающее из-за потемнения, решает отдать остатки своей силы Дит.

СкекМал после стычки с главными героями смертельно ранен и даже ессенция не способна излечить его. Мать Огра, преследуя некий план предлагает пожертвовать собой, чтобы излечить скекМала. Риан и Дит находят поочерёдно обе части меча, способного свергнуть скексисов. Аратимы помогают освободить оставшихся гельфлингов из тюрьмы, их преследуют скексисы и убивают принцессу Тавру

Кланы и главные герои объединяются вместе, чтобы столкнуться в решающей битве со скексисами. Сначала погибает скекВар, смертельно раненный Рианом в честном бою и затем предательски убитый скекСилом, также погибает скекМал, после того, как его странник-двойник кончает самоубийством, после чего из его бездыханного тела возрождается мать Огра. Оставшиеся скексисы сбегают в крепость.